Sito presso il convento di San Domenico, il Museo è nato nel 1857 dalle ricerche del geologo e paleontologo Giuseppe Scarabelli e si è accresciuto grazie a donazioni private.

Caso esemplare di conservazione di ordinamento museografico ottocentesco, l'esposizione rispetta la rigorosa impostazione originaria: la sezione archeologico-preistorica con reperti provenienti da giacimenti paleolitici e da siti dell'età del bronzo, quella geologica con una ricca collezione di rocce, minerali e fossili ed altre raccolte, e infine la sezione naturalistica.